El 'número dos' del gabinete civil de la Presidencia, Sabine Ntakarutimana, ha detallado que la decisión se tomó a principios de año, argumentando que se debe a los impagos a tropas burundesas desplegadas en la misión.
La AMISOM cuenta con 5.400 soldados burundeses, lo que supone el segundo mayor contingente en la misión, financiada por la Unión Europea (UE).
El bloque regional impuso sanciones a Burundi después de que el presidente, Pierre Nkurunziza, anunció en abril de 2015 que se presentaría a un tercer mandato en las elecciones, provocando manifestaciones en su contra y un intento fallido de golpe de Estado.
La AMISOM ayuda al Ejército de Somalia en su lucha contra la milicia islamista Al Shabaab, vinculada a la organización terrorista Al Qaeda y cuyo objetivo es derrocar al Gobierno e instaurar la ley islámica en su versión más radical.