En esta temporada se despejan muchas dudas acerca del pasado de Kyle, sobre todo para la familia Trager, que no sabe qué pensar sobre este peculiar joven. Nicole, Stephen, Lori y Josh deben afrontar una dura prueba con las inesperadas confesiones de Kyle y tienen que decidir si lo aceptan como uno más.
Paralelamente, más allá de las conspiraciones de la peligrosa empresa Madacorp, Kyle continua luchando por ser un chico normal con una vida corriente, sobre todo con respecto a Amanda, de la que sigue verdaderamente enamorado.
Sin embargo, las cosas no son tan fáciles como parecen, entre otras cosas, por la presencia de Jessi XX.