La fundación ha llevado a cabo su intervención en España a través de los programas 'Intervención con Menores en Conflicto con la Ley', con 181 adolescentes acompañados en el cumplimiento de medidas judiciales impuestas por los juzgados de menores; 'Protección de Infancia y Adolescencia', con 280 niñas, niños y adolescentes en situación de guarda o tutela acogidos y atendidos; o 'Prevención y Participación', gracias al cual 4.893 menores y jóvenes participaron en acciones de información, sensibilización, prevención de conductas conflictivas y de adicciónes, participación social, ocio saludable o apoyo extraescolar.
Además, también realizó los programas 'Emancipación y Apoyo a la Inserción Sociolaboral', con 279 jóvenes y mujeres en proceso de emancipación acogidos en sus viviendas tuteladas y participando en acciones de inserción social; 'Intervención Familiar y Atención a la Violencia Filio-parental', con 762 familias atendidas por graves conflictos con sus hijos e hijas adolescentes; 'Intervención en Adicciones', con 272 menores y personas adultas en tratamiento de rehabilitación de conductas adictivas en régimen residencial o ambulatorio; 'Sensibilización y Educación para el Desarrollo', a través del cual 8.291 personas participaron en las campañas de educación que la entidad realiza en diferentes centro educativos.
Durante 2016, Fundación Amigó inauguró cinco nuevos proyectos y centros: el Proyecto Insola en Castellón, para favorecer la inserción sociolaboral de personas con adicciones; un piso de su Programa de Acompañamiento a la Emancipación; tres pisos semitutelados a través del Proyecto de Apoyo Social València Inclou; el Servicio de Mediación Intercultural en el Centro de Recepción de Menores de Alicante; y el Centro de Acogida de Menores Margarita Nasseau también en Alicante.