Según las informaciones recogidas por la emisora Radio France Internationale, las víctimas mortales son cinco militares malienses y un civil.
Los militares murieron en un ataque contra su convoy que transportaba urnas electorales en la localidad de Duentza.
Las autoridades han indicado que el ataque fue obra de "terroristas" presuntamente encabezados por un jefe yihadista que opera en la localidad de Gao identificado como El Mansur.
Por su parte, el civil murió tras ser tiroteado en la localidad de Nara, sin que por el momento estén claras las circunstancias del suceso.
La jornada electoral estuvo marcada por las protestas y los enfrentamientos, en medio del boicot convocado por varios partidos opositores y los grupos tuareg del norte del país.
La oposición, al igual que los diversos grupos armados que participan en el proceso de paz auspiciado por la ONU, ha criticado la votación y ha señalado las profundas divisiones que aún afectan a la antigua colonia francesa después de tres años de guerra.
Mientras, desde el Gobierno defienden la legitimidad de las elecciones. "Ya hemos retrasado cuatro veces estas elecciones para que puedan ser inclusivas y cuatro veces es suficiente", declaró el presidente, Ibrahim Boubacar Keita, tras depositar su voto.
A pesar de que los yihadistas fueron expulsados por una operación militar liderada por Francia un año después de que en 2012 aprovecharan la rebelión tuareg para conquistar las principales ciudades del desierto de Malí, han continuado lanzando ataques contra el Ejército y la ONU. En los últimos meses también han intensificado su insurgencia y se han extendido hacia el sur.