El segundo hijo del guionista de y conductor de la ABC y su esposa, Molly McNearney, fue sometido a una cirugía después de que se descubriera que su corazón no estaba recibiendo suficiente oxígeno, para funcionar con normalidad. Al final del monólogo, Jimmy animó a los espectadores a donar al Children's Hospital de Los Angeles, ya que ninguna familia debería tener que decidir si pueden permitirse el lujo de salvar la vida de sus hijos.
Este es el cuarto hijo para el productor televisivo. En 1988 contrajo matrimonio con Gina Maddy, madre de Kevin y Katherine, sus dos hijos mayores. El matrimonio se acabó en 2002 y tras varias relaciones de pareja, entre ellas Sarah Silverman, el showman volvió a pasar por el altar junto a Molly, madre de Jane, que en julio cumplirá tres años, y Billy, el vivo retrato de su padre.