Tom y Semir son los principales sospechosos de un asesinato relacionado con un camión que transportaba armas. Con la ayuda de los compañeros de la brigada de carreteras consiguen huir de la policía, pero para probar su inocencia deberán antes detener el próximo envío. Éste será el leiv motiv de la sexta temporada de Alerta Cobra.
Además, Tom deberá descubrir qué ocurrió con Semir para que no termine encarcelado de por vida. Su compañero sufre un grave accidente en la carretera después de conducir de una manera muy temeraria. En el hospital, Semir descubre que tiene altos niveles de alcohol y drogas en sangre. No puede recordar nada de nada pero el coche que conducía había sido robado y era responsable de un atropello con consecuencias mortales...
Capítulo 1
1.- Caza sin tregua (Parte 1)
2.- Caza sin tregua (Parte 2)
3.- El pequeño
4.- Indefensa
5.- Fuego cruzado
6.- Ovejas negras
7.- Venganza tardía
8.- Memoria perdida
9.- Padre e hijo
10.- Las joyas de la traición
11.- Hasta el amargo final
12.- Muerte de un reportero
13.- Arte mortal
14.- El asesinato perfecto
15.- Caída en picado
16.- La pandilla
17.- Sombras del pasado
18.- Despedida