El juez de la Audiencia Nacional Baltasar Garzón ha procesado a 44 miembros de Batasuna, el Partido Comunista de las Tierras Vascas (PCTV) y Acción Nacionalista Vasca (ANV) por integración en organización terrorista, al considerar que con su acción han servido a los intereses de ETA.
Entre los procesados se encuentran dirigentes de Batasuna como Pernando Barrena, Joseba Permach, Juan José Petrikorena y Rufino Etxeberria; de PCTV como Peio Gálvez; y de ANV como la alcaldesa de Mondragón (Guipúzcoa), Inocencia Galparsoro, y el presidente de esta formación Kepa Bereziartua.
El magistrado argumenta que todos los procesados han contribuido a la obtención de un "fin delictivo común siguiendo las directrices de la organización terrorista ETA, que lidera el complejo en que se integran las demás estructuras y personas citadas". Garzón sostiene además que Batasuna "ha utilizado las nuevas marcas del complejo (PCTV y ANV) para continuar la acción delictiva a través del frente institucional del complejo terrorista".
Los 44 procesados fueron detenidos en diferentes operaciones que se desarrollaron entre el 4 de octubre de 2007 y el 11 febrero de 2008. La pertenencia de los procesados a ETA queda acreditada, según Garzón, por documentos de ANV y PCTV incautados en los distintos registros a estas formaciones.