Isern fue un destacado botánico, miembro de la Comisión Científica del Pacífico que, entre otros objetivos, tenía la labor de enriquecer los fondos de los museos españoles y contribuir a desarrollar el programa de aclimatación de animales y vegetales exóticos que fuesen útiles a la economía española.
En el Real Jardín Botánico se conservan más de 25.000 ejemplares de plantas secas macaronésicas y americanas colectadas, principalmente, por Juan Isern. Además, se conservan las plantas recogidas durante sus excursiones por la Península, así como el diario de la Expedición, que ingresó en el Archivo en 1926.
